MFPL - Zentrum für Molekulare Biologie

Erforschung molekularer Lebensprozesse mit Hilfe von High Performance Computing

Bojan Zagrvic, PhD
Bojan Zagrvic, PhD, MFPL

Am Zentrum für Molekulare Biologie (Max F. Perutz Laboratories) erforscht eine Projektgruppe unter der Leitung von Bojan Zagrovic u. a. mittels Computersimulation die komplexen Bewegungen und Wechselwirkungen von Proteinen. Im Rahmen des Projekts werden auch verteilte Computertechniken – sogenannte "distributed computing techniques" – weiterentwickelt und angewandt. Für diese spezifischen Aufgaben sind hohe Rechenleistungen erforderlich, denen die zuvor eingesetzten Linux-Workstations nicht mehr gewachsen waren.

EDV-Design konfigurierte eine Lösung mit HP, basierend auf 4-Knoten-Chassis. Sie inkludiert fünf 4-Node-Chassis mit 18 Cluster-Knoten, Webserver und Management-Server.
Ein extra HP Proliant DL380G7 fungiert als Fileserver. Dieser Server ist verbunden mit einem hochskalierbaren HP P2000-Storage-System mit 48TB SAS, erweiterbar bis zu 192TB. Alle Knoten sind über QDR-Infiniband Interfaces mit einem zentralen Switch verbunden.

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